行政机关实施行政许可过程中存在的一个重要问题，就是程序不健全，或者即使有法定程序，一些行政机关及其工作人员也不按照法定程序为申请人办理许可申请。程序不健全，或者有程序却不按照程序办事产生的直接后果就是：官僚主义作风盛行；个人或者组织在申请办理行政许可的过程中会“门难进、脸难看、事难办”，其合法权益得不到保障；行政管理效率降低；行政许可中的腐败现象随之产生等。针对行政许可实施过程中的这些问题，本法专门对行政许可实施的一般程序以及一些特殊行政许可实施的程序作出详细规定。其他的法律、法规对一些具体行政许可的实施程序也作出了详细规定。行政机关及其工作人员在行政许可的实施过程中，必须严格按照法定程序办事，违反了法定程序就要承担相应的责任。本条内容就是对违反法定程序的责任作出的具体规定。
一、违反法定程序的各类情形
行政机关及其工作人员在实施行政许可的过程中，有下列情形之一的，就应当承担相应的法律责任：一是对于符合法定条件的行政许可申请不予受理的。在行政许可实施中，收到申请人符合条件的许可申请却久拖不办的现象比较普遍，个别行政机关及其工作人员甚至借实施行政许可对申请人“吃、拿、卡、要”。根据本法第三十二条的规定，行政机关对于申请人的申请事项属于本机关职责范围，申请材料齐全、符合法定形式的，行政机关应当受理行政许可，否则即属于违法。二是不在办公场所公示依法应当公示的材料的。根据本法第三十条的规定，行政机关应当将有关法律、法规、规章规定的有关行政许可的事项、依据、条件、数量、程序、期限以及需要提交的全部材料的目录和申请书示范文本等在办公场所公示。如果行政机关不依法在办公场所公示有关材料的即属于违法。三是在受理、审查、决定行政许可过程中，未向申请人、利害关系人履行法定告知义务的。行政机关对行政许可申请进行初步审查后，发现行政许可事项直接关系其他人重大利益的，应当告知该利害关系人。行政机关对于延长作出行政许可决定期限的。应当将延长期限的理由告知申请人。行政许可直接涉及申请人与他人之间重大利益关系的，行政机关在作出行政许可决定前，应当告知申请人、利害关系人有要求听证的权利。行政机关在实施行政许可的过程中，应当认真履行上述告知义务，否则即属于违法。四是申请人提交的申请材料不齐全、不符合法定形式，不一次告知申请人必须补正的全部内容的。申请人的申请材料不齐全或者不符合法定形式的，行政机关应当一次告知申请人需要补正的全部内容。实践中，个别行政机关及其工作人员对于申请人申请材料不齐全或者不符合法定形式的，故意不一次告知申请人应当补正的全部内容，增加申请人的负担。五是未依法说明不受理行政许可申请或者不予行政许可的理由的。行政机关对申请人的行政许可申请，应当根据不同情况作出处理，对于不受理行政许可申请的，应当说明理由和依据。行政机关依法作出不予行政许可的书面决定的，应当说明不予行政许可的理由，否则即属于违法。六是依法应当举行听证而不举行听证的。法律、法规、规章规定实施行政许可应当听证的事项，或者行政机关认为需要听证的其他涉及公共利益的重大行政许可事项，行政机关应当向社会公告，并举行听证，否则即属于违法。行政机关及其工作人员在实施行政许可的过程中，有上述违法行为之一的，即应当依据本条规定承担相应的法律责任。
二、对违法行为的处理
行政机关及其工作人员对其实施行政许可过程中的上述违法行为，承担的是行政法律责任。追究这一行政法律责任的机关有两个：一是上级行政机关。上级行政机关对下级行政机关的日常工作负有领导和监督责任，下级行政机关及其工作人员实施行政许可的活动当然也是其领导和监督的重要内容，一旦发现有违法行为，上级行政机关即有权予以处理。二是监察机关。监察机关是人民政府行使监察职能的机关，依法对行政机关、国家公务员和行政机关任命的其他人员实施监察。根据行政监察法的有关规定，监察机关有权依法检查行政机关及其工作人员遵守和执行法律、法规和人民政府的决定和命令中的问题，并有权根据检查、调查结果，作出监察决定或者对行政机关提出监察建议。据此，对行政机关及其工作人员是否严格依法实施行政许可，就是监察机关行使监察权的重要内容。如果发现行政机关及其工作人员有上述违法情形之一的，监察机关即可予以处理。
上级行政机关或者监察机关对行政机关及其工作人员实施行政许可中的上述违法行为，依法处理的方式是责令改正；情节严重的，对直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法给予行政处分。责令改正是指责令有违法行为的行政机关及其工作人员改正其违法行为。行政处分是对违反行政纪律的人员给予的处分。根据国家公务员暂行条例第三十三条的规定，行政处分分为警告、记过、记大过、降级、撤职、开除六种。对行政机关及其工作人员在实施行政许可过程中的上述违法行为，情节严重的，监察机关或者上级行政机关可以对直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法根据不同情况作出警告、记过、记大过、降级、撤职、开除等不同处分。
